Programele de studiu de Masterat durează doi ani, fiecare împărțit în două semestre, aplicându-se sistemul de acordare al creditelor.
Masterele oferite de Facultatea de Matematică și Informatică sunt:
Algoritmi și bioinformatică, Baze de date și tehnologii web, Inginerie software, Inteligență artificială, Programare declarativă, Sisteme distribuite, Algebră, Analiză matematică, Criptografie și teoria
codurilor, Geometrie, Matematică aplicată în finanțe, actuariat și biostatistică, Modelare matematică în științele naturii și știința materialelor – cursuri de zi, și Baze de date, Biostatistică – învățământ la
distanță. Planurile de învățământ pentru cursurile la zi se găsesc la adresa pentru masterele de informatică, pentru masterele de matematica, iar cele pentru învățământul la distanță – masterul de baze de date și cel de biostatistică.
